Vượt qua sự tàn phá của thời gian, Nhà thờ Giáng Sinh đã đứng vững qua hàng thiên niên kỷ. Bất chấp sự thay đổi quyền lực chính trị, Nhà thờ Giáng Sinh may mắn vẫn đứng vững. Ngày nay, nhà thờ được quản lý chung bởi Giáo hội Công giáo La Mã, Giáo hội Chính thống giáo Hy Lạp và Giáo hội Tông truyền Armenia. Năm 2012, Nhà thờ Giáng Sinh đã được UNESCO công nhận là Di sản Thế giới tại Palestine. Năm 2016, một nhóm chuyên gia phục chế người Ý đã phát hiện ra một bức bích họa tuyệt đẹp từ thế kỷ thứ tư trước Công nguyên ẩn sau một bức tường bê tông. Thật bất ngờ, đó lại là một bức tranh tường khảm gạch tuyệt đẹp, và sau khi được sơn lại, nó đã lấy lại vẻ lộng lẫy vốn có.